На сей раз Шреддер и Крэнг задумал захватить мир с помощью Hyperstone - камней из Измерения Х. Злодеи уменьшают остров Манхэттен, вместе со статуей Свободы и аудиторией Эйприл О’Нил, ведущей свой репортаж с острова Эллис. Черепашки-ниндзя точат оружие, заряжают Кавабангу в панцири и выдвигаются!