プロトタイプは、第三者視点のアクションジャンルのマルチプラットフォームコンピュータゲームです。開発はラジカルエンターテインメント、出版はアクティビジョン（ロシアではソフトクラブ）によって行われました。プロトタイプは、2009年6月にPC、Xbox 360およびPlayStation 3という主要な3つのプラットフォームでリリースされました。
ゲームのストーリーは、冷戦の最中にアメリカ軍によって培養された危険なウイルスが中心となっています。実験中に失敗が生じ、危険な株が外に漏れ出し、小さな町の住民を感染させます。危険な病気のさらなる拡散を防ぐために、勇敢な兵士たちは町を完全に焼き払います。しかし、いくつかの地元住民はこの恐ろしい大惨事から生き残ることができました。誰かは逃げ、誰かは捕まり、極秘の研究所へ送られました。
40年後、ウイルスは再び姿を現しましたが、今はアメリカの人里離れた地域ではなく、人口密集地のニューヨークでです。大都市は混乱に陥り、武装した集団でいっぱいになっており、周囲には厳格に通行が禁止された検問所が設けられています。境界を侵害した場合、兵士たちは即座に発砲します。実際、摩天楼に囲まれた市内で物語は展開します。主人公はアレックス・マーカスという名の人物であり、彼は自分の過去の生活についてほとんど何も覚えていませんが、彼に何か恐ろしいことが起こったことだけは知っています。その結果、彼は新たな存在に気づくと、正気を保つのが難しくなります。
そう、ウイルスはマーカスを本物のミュータントにしました。軍の兵士たちが戦車の支援を受けて主人公を追跡します。特別部隊「ブラックオーダー」の特殊部隊員や他の感染者も参加します。物語が進むにつれて、マーカスはすべてが一見思ったほど簡単ではないことに気づきます。しかし、マーカスにとって最も重要な任務は、自分自身を救うことです。ニューヨークにはまもなく核弾頭が投下される予定であり、軍からのこの過激な行動に立ち向かえるのは超人的な能力を持つ者だけです。
プレイヤーは初めから大都市を探索しながら、ストーリーのミッションやサイドクエストを遂行することができます。ウイルスによって引き起こされたマーカスのユニークな能力は、彼が巨大な距離を跳び、文字通り壁を駆け上がることを可能にします。また、主人公は触手や爪を伸ばし、筋肉量を増加させ、全身を防弾の鎧で覆うことができます。マーカスのもう一つの重要な特徴は、近くにいる人々を食べることができ、その結果、健康を回復することです。食事を通じたこのカニバリズム形式のもう一つの利点は、アレックスが吸収行為の後に再変身できることです。例えば、兵士を食べることで、アレックス・マーカスはその外見と服装を手に入れ、その後特に危険な検問所をこっそり通り抜けることができます。