Marvel Ultimate Alliance es un videojuego que narra las aventuras de los héroes de los cómics de Marvel. El mundo está nuevamente en peligro, y esta vez el villano principal es el famoso Doctor Doom. Él ataca la base de los superhéroes de S.H.I.E.L.D, y solo ellos, los poseedores de habilidades sobrehumanas, pueden salvarla de la destrucción total. Pero no todo es tan simple como parecía al principio. El Doctor Doom planea no solo conquistar este mundo, sino también tomar el control de otros. Los héroes tendrán que viajar a Atlantis, Asgard e incluso al Infierno, tratando de frustrar los planes del astuto villano.
Marvel Ultimate Alliance ofrece a los jugadores casi todos sus conocidos superhéroes. Puedes jugar como Spider-Man, Wolverine, Daredevil, Black Panther, Punisher, Blade, etc. En total, hay alrededor de 140 personajes en el juego. En el equipo puede haber un máximo de 4 héroes, uno controlado por el jugador y los otros por la IA. Sin embargo, durante el juego puedes cambiar fácilmente entre los miembros del equipo, si crees que puedes utilizar las habilidades de un héroe de manera más efectiva (a diferencia de la IA). Además, en ciertos lugares de los niveles hay