मार्वल आल्टिमेट एलायंस एक कंप्यूटर गेम है, जो मार्वल के कॉमिक्स के नायकों के कारनामों की कहानी कहता है। दुनिया फिर से खतरे में है, और इस बार मुख्य खलनायक कोई और नहीं, बल्कि प्रसिद्ध डॉ. डूम है। वह सुपरहीरो बेस S.H.I.E.L.D पर हमला करता है, और इसे पूर्ण विनाश से बचाने के लिए केवल वही लोग सक्षम हैं – जिनके पास सुपर क्षमताएं हैं। लेकिन पहले जैसा आसान नहीं है। डॉ. डूम ने केवल इस दुनिया को गुलाम बनाने की योजना बनाई है, बल्कि वह अन्य दुनिया पर भी नियंत्रण प्राप्त करने का इरादा रखता है। नायकों को अटलांटिस, असगर्ड और यहां तक कि नरक का अनुभव करना पड़ेगा, चतुर खलनायक की योजनाओं को नष्ट करने की कोशिश करते हुए।
मार्वल आल्टिमेट एलायंस खिलाड़ियों को लगभग सभी ज्ञात सुपरहीरो की पेशकश करता है। इस खेल में आप स्पाइडर-मैन, वोल्वरिन, डेड पूल, ब्लैक पैंथर, पनिशर, ब्लेड आदि के रूप में खेल सकते हैं। कुल मिलाकर खेल में लगभग 140 पात्र हैं। टीम में अधिकतम 4 नायक हो सकते हैं, एक खिलाड़ी के नियंत्रण में और अन्य AI के नियंत्रण में। हालांकि, खेल के दौरान सदस्य के बीच आसानी से स्विच किया जा सकता है, यदि आप समझते हैं कि किसी विशेष नायक की क्षमताओं का उपयोग आप अधिक प्रभावशाली रूप से कर सकते हैं (AI की तुलना में)। इसके अलावा, स्तरों के कुछ विशेष स्थानों पर ऐसे विशेष "प्वाइंट" हैं, जहां टीम को फिर से संगठित किया जा सकता है। इस प्रकार, कोई भी आपको उन नायकों के साथ स्तर को पूरा करने के लिए मजबूर नहीं करता है, जिन्हें आपने खेल की शुरुआत में चुना था।
प्रत्येक पात्र के पास अपनी विशेष चालों और कौशलों का एक सेट होता है। किसी विशेष विशेषता को बेहतर बनाने के लिए आपको अनुभव बिंदु जमा करने होंगे, जिसके बाद आप उन्हें मैनुअल या स्वचालित तरीके से वितरित कर सकते हैं। इसके अलावा, प्रत्येक सुपरहीरो के लिए अतिरिक्त कॉस्ट्यूम डिज़ाइन किए गए हैं, जो उसकी मूल क्षमताओं को बढ़ाते हैं या सुपरहीरो के हथियारों में पूरी तरह से नई क्षमताएँ जोड़ते हैं। कुछ आरपीजी तत्वों के बावजूद, खेल एक मानक एक्शन गेम है जिसमें सभी पार्श्विक तत्व शामिल हैं। जो कुछ भी स्क्रीन पर होता है, उसे कभी-कभी सर्वश्रेष्ठ हॉलीवुड ब्लॉकबस्टर्स के साथ तुलना की जा सकती है। कूद, विस्फोट, धुआं, गिरावट और अन्य कुल विनाश।
कई विरोधियों के खिलाफ लड़ाई में नायकों की अद्वितीय क्षमताएँ मदद करती हैं।
मार्वल आल्टिमेट एलायंस में कई पात्र निकटता हमले पर आधारित हैं, लेकिन कुछ हवा में उड़ सकते हैं। यह विशेष रूप से बख्तरबंद विरोधियों से लड़ाई में मदद करता है, और उनके लिविटेशन की क्षमताएँ बॉस से लड़ाई में भी काम आएंगी।
यह ध्यान देने योग्य है कि मार्वल आल्टिमेट एलायंस को दोस्तों के साथ खेलना कहीं अधिक मजेदार है। अगर किसी समय सुपरहीरो की यात्रा आपको बोर कर देती है, भले ही आप मार्वल के कॉमिक्स के प्रशंसक हों, तो सह-ऑप मोड गेम को आगे बढ़ाने के लिए एक मजबूत प्रोत्साहन देगा।