Marvel Ultimate Alliance is een computerspel dat het verhaal vertelt over de avonturen van superhelden uit de comics van Marvel. De wereld is weer in gevaar, en deze keer is de belangrijkste schurk de beruchte Doctor Doom. Hij valt de basis van de superhelden S.H.I.E.L.D aan, en alleen zij – de bezitters van superkrachten – kunnen deze redden van totale vernietiging. Maar het is niet zo eenvoudig als het in eerste instantie leek. Doctor Doom heeft niet alleen de plannen om deze wereld te veroveren, maar ook om andere onder zijn controle te krijgen. De helden zullen naar Atlantis, Asgard en zelfs de Hel moeten, terwijl ze proberen de plannen van de gemene schurk te verijdelen.
Marvel Ultimate Alliance biedt spelers de mogelijkheid om bijna al zijn bekende superhelden te spelen. Je kunt spelen als Spider-Man, Wolverine, Daredevil, Black Panther, The Punisher, Blade, enzovoort. In totaal zijn er ongeveer 140 personages in het spel. Maximaal 4 helden kunnen in een team zitten, één bestuurt de speler en de anderen worden aangestuurd door de AI. Desondanks kun je tijdens het spelen eenvoudig tussen teamleden wisselen als je begrijpt dat je de vaardigheden van een bepaalde held effectiever kunt inzetten (in tegenstelling tot de AI). Bovendien zijn er op bepaalde plaatsen in de niveaus speciale "points" waar je je team kunt ontbinden en opnieuw kunt samenstellen. Op deze manier wordt niemand gedwongen om een locatie te doorlopen met de helden die je aan het begin hebt gekozen.
Elk van de personages heeft zijn eigen set van speciale technieken en vaardigheden. Om een bepaalde eigenschap te verbeteren, moet je ervaringspunten verzamelen en deze vervolgens zowel handmatig als automatisch verdelen. Bovendien zijn er voor elke superheld extra kostuums beschikbaar die zijn basisvaardigheden verbeteren of nieuwe vaardigheden aan het arsenaal van de held toevoegen. Ondanks enkele RPG-elementen is het spel een typische actiegame met alle gevolgen van dien. Wat er op het scherm gebeurt, kan soms worden vergeleken met de beste buitenlandse blockbusters. Sprongen, explosies, rook, val en andere totale vernietiging.
Bij het vechten tegen talrijke tegenstanders helpen de unieke vaardigheden van de helden.
Veel personages in Marvel Ultimate Alliance zijn gericht op close combat, maar sommige kunnen de lucht in stijgen. Dit helpt vooral bij het vechten tegen bepantserde tegenstanders, en hun levitatievaardigheden zijn nuttig bij het vechten met eindbazen.
Het is vermeldenswaard dat het veel leuker is om Marvel Ultimate Alliance met vrienden te spelen. Als je op een bepaald moment de avonturen van de superhelden saai vindt, zelfs als je een fan bent van Marvel-comics, geeft de coöperatieve spelmodus een sterke stimulans om door te gaan met het spel.