Die Aufgabe der Polizei besteht darin, Verbrecher zu fangen. Die Aufgabe der Spezialeinheiten besteht darin, Menschen vor Terroristen zu retten. Die Armee ist bereit, das Land gegen eine andere Armee zu verteidigen. Aber es gibt Situationen, in denen das Unbegreifliche passiert, wenn eine andere Welt sich gegen die Welt der Menschen erhebt. In diesem Fall kommt F.E.A.R. – die Föderale Einheit für Aktive Reaktion – ins Spiel.
Die Handlung beginnt wie ein klassischer Actionfilm. Terroristen übernehmen eine geheime Militäranlage, nehmen Geiseln und stellen keine Forderungen. Ein Team von Spezialkräften wird auf den Fall angesetzt, aber der Kontakt zu ihnen bricht bald ab. Nach einiger Zeit senden die Überwachungskameras jedoch ein Signal. Doch das, was sie zeigen, ist erschreckend – die Körper der Soldaten werden von einer unbekannten Kraft zerfetzt, bevor sie irgendetwas begreifen können…