El trabajo de la policía es atrapar criminales. El trabajo de las fuerzas especiales es salvar a las personas de los terroristas. El ejército está listo para defender el país de otro ejército. Pero hay casos en los que ocurre lo inexplicable, cuando otro mundo se levanta contra el mundo de los humanos. En este caso, F.E.A.R. — la Unidad Federal de Respuesta Activa — entra en acción.
La trama comienza como una película de acción clásica. Los terroristas toman un centro militar secreto, toman rehenes y no hacen demandas. Se envía un equipo de fuerzas especiales, pero pronto se pierde el contacto con ellos. Sin embargo, después de un tiempo, las cámaras de vigilancia emiten una señal. Pero la imagen que muestran es aterradora: los cuerpos de los soldados son desgarrados por una fuerza desconocida antes de que puedan entender algo...