Zadanie policji to łapanie przestępców. Zadaniem jednostek specjalnych jest ratowanie ludzi przed terrorystami. Armia jest gotowa bronić kraju przed inną armią. Jednak zdarzają się przypadki, gdy dzieje się coś niewytłumaczalnego, gdy inny świat przeciwstawia się światu ludzi. W takim przypadku kontaktuje się F.E.A.R. — Federalna Jednostka Aktywnej Reakcji.
Fabuła zaczyna się jak klasyczny film akcji. Terroryści zajmują tajną bazę wojskową, biorą zakładników, nie wysuwają żadnych żądań. Na miejsce wysyłana jest drużyna jednostek specjalnych, ale szybko tracą z nimi kontakt. Jednak po pewnym czasie kamery bezpieczeństwa wysyłają sygnał. Ale to, co pokazują, przeraża – ciała żołnierzy są rozrywane na kawałki przez nieznaną siłę, zanim zdążą cokolwiek zrozumieć...