Deus Ex: Ανθρώπινη Επανάσταση — είναι το τρίτο παιχνίδι της σειράς και αποτελεί προquel του αυθεντικού Deus Ex. Η υπόθεση του HR διαδραματίζεται το 2027, 25 χρόνια πριν από τα γεγονότα που περιγράφονται στον πρώτο Deus Ex. Η δράση του παιχνιδιού συμβαίνει σε πέντε μητροπόλεις (συμπεριλαμβανομένων των Ντιτρόιτ, Σαγκάη και Μόντρεαλ), σε διάφορες γωνιές του κόσμου. Ο κύριος ήρωας, Άνταμ Τζένσεν, είναι υπάλληλος της υπηρεσίας ασφαλείας Sarif Industries, μιας κορυφαίας εταιρείας στον τομέα των βιομηχανικών λειτουργιών στο ανθρώπινο σώμα. Επιβιώνει μετά από επίθεση στο γραφείο της εταιρείας, αλλά αναγκάζεται να συμφωνήσει να υποβληθεί σε εμφύτευση ειδικών βιοχημικών εμφυτευμάτων για να παραμείνει ζωντανός.
Τα παιχνίδια της σειράς Deus Ex περιστρέφονται γύρω από τον τακτικό gameplay που επιτρέπει στους παίκτες να πάρουν κρίσιμες αποφάσεις οποιαδήποτε στιγμή. Το HR περιλαμβάνει τέσσερις βασικές δόσεις gameplay — Μάχη (άμεση επίθεση με όπλα), Στελθ (αθόρυβη διείσδυση και αποασφάλιση του αντιπάλου), Χάκινγκ (απόκτηση πληροφοριών για κρυφούς πόρους και αλλαγή ελέγχου της τεχνολογίας μέσω ειδικών συσκευών) και Κοινωνικές Δεξιότητες (συζητήσεις με ανθρώπους και χειραγώγησή τους προς όφελός τους). Οι παίκτες μπορούν να επιλέξουν τον τρόπο συμπεριφοράς τους ή να εναλλάσονται μεταξύ αυτών ανά πάσα στιγμή της αφήγησης. Επιπλέον, οι επιλογές συμπεριφοράς συνδυάζονται καλά μεταξύ τους.
Σε αντίθεση με τα προηγούμενα παιχνίδια της σειράς, στο Human Revolution υπάρχει μοντέλο αποκατάστασης υγείας. Τέτοιες αλλαγές έγιναν ώστε οι παίκτες να μην βρίσκονται σε κατάσταση όπου δεν μπορούν να συνεχίσουν το παιχνίδι και αναγκάζονται να ψάξουν για κιβώτιο πρώτων βοηθειών ή φαγητό. Οι προγραμματιστές θεωρούν ότι η περίπτωση όπου οι παίκτες αναγκάζονται να αφήσουν την πλοκή του παιχνιδιού και να ψάξουν για κιβώτιο πρώτων βοηθειών σε όλο το επίπεδο είναι αρνητική. Κατά την άποψή τους, το μοντέλο αποκατάστασης ενθαρρύνει την ανάπτυξη τακτικών και στρατηγικών δεξιοτήτων, χωρίς να απαιτεί απομάκρυνση από την αφήγηση της πλοκής. Παρά τη νέα μονάδα αποκατάστασης υγείας, το παιχνίδι έχει αποθέματα τροφίμων που χρησιμοποιούνται επίσης για αυτό τον σκοπό.
Μία ακόμη αλλαγή στο παιχνίδι είναι η οπτική επισήμανση των αντικειμένων με τα οποία μπορεί να αλληλεπιδράσει ο χαρακτήρας. Αυτό το εφέ εξηγείται ως τροποποίηση της τακτικής όρασης. Όμως, αυτή η επισήμανση μπορεί επίσης να απενεργοποιηθεί αν το επιθυμείτε.