Deus Ex: Human Revolution — é o terceiro jogo da série, sendo uma prequela do original Deus Ex. A trama de HR se desenrola em 2027, 25 anos antes dos eventos descritos no primeiro Deus Ex. A ação do jogo acontece em cinco megalópoles (incluindo Detroit, Xangai e Montreal), em diferentes partes do mundo. O protagonista, Adam Jensen, é um funcionário da segurança da Sarif Industries, uma empresa líder em operações bio-mecânicas no corpo humano. Ele sobrevive a um ataque ao escritório da empresa, mas é forçado a aceitar a inserção de implantes bioquímicos especiais em seu corpo para permanecer vivo.
Os jogos da franquia Deus Ex giram em torno do gameplay tático, que permite aos jogadores tomar decisões críticas a qualquer momento. HR inclui quatro estilos de jogabilidade principais — Combate (ataque direto com armas), Stealth (infiltração discreta e desarmamento do inimigo), Hacking (obtenção de informações sobre recursos ocultos e controle de tecnologia através de dispositivos especiais), e Habilidades Sociais (diálogos com pessoas e manipulação delas para ganho próprio). Os jogadores podem escolher um estilo de comportamento que seja confortável para eles ou alternar entre eles a qualquer momento da narrativa. Além disso, os diferentes estilos de comportamento se combinam perfeitamente.
Diferente dos jogos anteriores da série, em Human Revolution existe um modelo regenerativo de recuperação de saúde. Essas mudanças foram feitas para que o jogador não ficasse em uma situação onde não pudesse continuar o jogo e tivesse que procurar por um kit de primeiros socorros ou comida. Os desenvolvedores acreditam que o caso em que o jogador é forçado a deixar a trama do jogo para buscar um kit de primeiros socorros por todo o nível é um resultado negativo. Na opinião deles, o modelo regenerativo incentiva o desenvolvimento de habilidades táticas e estratégicas, mas não exige a renúncia à narrativa. Apesar do novo modelo de recuperação de saúde, o jogo ainda tem suprimentos de alimentos usados para esse mesmo fim.
Outra mudança no jogo é a realce visual de objetos com os quais o personagem pode interagir. Esse efeito é descrito como uma modificação da visão tática. Mas essa realce de objetos pode ser desativada, se desejado.