Așa cum se întâmplă în majoritatea jocurilor din acest gen, în EE este necesar să te dezvolți, să îți crești populația, să construiești clădiri și să distrugi imperiile ostile. O caracteristică a acestui joc este că pentru toate acestea ai la dispoziție 500.000 de ani. Jocul include 14 epoci, începând cu preistorică și terminând cu epoca nanotehnologiei.
Există posibilitatea de a crea propria civilizație cu bonusuri inițiale unice, dându-i astfel un caracter diferit față de toate celelalte. Pentru a te dezvolta, trebuie să produci muncitori care vor colecta lemn, hrană, aur, piatră, minereu de fier. Dezvoltarea poate fi împiedicată de imperiile ostile, iar pentru a te proteja de acestea, trebuie să construiești unități. În joc există numeroase unități și tehnologii diferite și două tipuri de „erou”: Strategul (care vindecă unitățile și demoralizează trupele inamice) și Războinicul (care crește moralul și îmbunătățește forța). La început, războinicii vor fi sălbatici cu ciomege și pietre, dar pe măsură ce epocile și tehnologiile avansează, vor apărea treptat soldați antrenați, tancuri, avioane de vânătoare, bombardiere dotate cu arme nucleare, roboți etc. La început, flota va include fregate, iar treptat vor apărea submarine, portaavioane etc.
EE are 19 civilizații, iar una dintre ele poate fi aleasă după începerea jocului sau îți poți crea propria.