עליכם לשחק בתור חייל מרינס לשעבר, שהופק לשירותים והועבר לעבוד במאדים, במתחם המעבדות של חברת UAC. משהו השתבש בניסוי עם הטכנולוגיה החדשה של הטרפולציה ועכשיו כל החדרים בבסיס המארסיני מלאים במפלצות ובשומרים משוגעים. והגיבור - הוא הניצול היחיד שצריך למצוא דרך לצאת מהגיהנום הזה.
עם זאת, עלילת המשחק היא רק כמה עמודים בקובץ וטקסט בסוף כל אחד משלושה (או ארבעה במהדורה האולטימטיבית) פרקים. העיקר ב-Doom - הוא המשחקיות שעשתה את המשחק לפריצת דרך בז'אנר השוטרים התלת מימדיים.
כל אחד מהפרקים מורכב מתשעה רמות (אחת מהן סודית ואינה חובה לעבור). ובכל רמה עליכם להגיע מהכניסה ליציאה (ושם בדרך כלל ללחוץ על כפתור רלוונטי). ברמה - מדובר בלבירינת עם הרבה מסלולים, דלתות (כולל נסתרים) ומפלצות. לפעמים, כדי להגיע ליציאה, צריך ללחוץ על כפתורים לפתיחת מעברים ולחפש מפתחות לדלתות נעולות.
ישנם לא פחות מ-8 סוגי נשק לעבודה על המפלצות - אגרוף, מסור חשמלי, אקדח, רובה, מקלע, רקטות, רובה פלזמה וכידון אימפקטי BFG-9000. לכל אחד מהם יש את היתרונות והחסרונות בעת השימוש. לדוגמה, האגרוף והמסור החשמלי פועלים רק בקרב קרוב, הרקטות יכולות לפגוע גם בכם אם יתפוצצו לידכם, וה-BFG משגר מטחים נוספים לאחר שהמטען הראשי פוגע במטרה.
במהלך המשחק יש לק verzamelen גם בונוסים שונים. נשקים שאין לכם עדיין, ערכות רפואיות, ושמירה (היא לוקחת על עצמה חלק מהנזק). במקלטים (לרוב הם מאחורי דלתות שנראות כמו קירות רגילים) ניתן למצוא "בונוסים-על", שמעלים את רמת הבריאות והשריון ל-200%, כמו גם מפת הרמה. למרבה המזל, ניתן לראות את המפה במשחק, אבל תוכלו לראות רק את המקומות שבהם הייתם.
למרות שהמשחק כולו תלת מימדי, ישנם מספר פרטים שצריך לקחת בחשבון. גם האקדח, המקלע והרובה פוגעים אוטומטית באויבים בהקשר ראייה, גם אם הם נמצאים הרבה מעליכם או מתחתיכם, אבל הרקטות והמטחים המפלאזמה (כמו גם סוגים שונים של "פגזים" של המפלצות) מוגבלים לטווח דיוק מסוים.
מוזר לציין את המולטיפלייר. Doom - אחת מהמשחקים הראשונים שהציעו אותו. הצטרפות לרשת המקומית אפשרית לשחק במשחק במצב שיתופי עם חברים, או להילחם אחד בשני, ולהרוויח נקודות עבור כל הריגה (ולאבד עבור כל "רצח עצמי") שנקראות במשחק פגזים.
המילה "פגז", כמו גם שם מצב ה-Deathmatch, הפכה למושגים ידועים בעולם המשחקים לאחר שחרור המשחק. לא מעט בזכות הפופולריות הבלתי נתפסת של Doom, ההמשך שלה ומשחקים אחרים של id Software.