Вам потрібно грати за колишнього морського піхотинця, розжалуваного в прибиральники та переведеного працювати на Марс, до лабораторного комплексу корпорації UAC. Щось пішло не так з експериментом з новою технологією телепортації, і тепер усі приміщення марсинської бази кишать монстрами та божевільною охороною. А головний герой — єдиний виживший, який повинен вибратися з цього пекла.
Проте сюжет гри — це лише кілька сторінок у файлі та тексту в кінці кожного з трьох (або чотирьох в Ultimate виданні) епізодів. Головне в Doom – це геймплей, що зробив гру проривом у жанрі тривимірних шутерів.
Кожен з епізодів складається з дев'яти рівнів (один з яких секретний і не є обов'язковим для проходження). А на кожному рівні вам необхідно дістатися від входу до виходу (і там найчастіше натиснути відповідний важіль). При цьому рівень — це лабіринт з безліччю проходів, дверей (в тому числі й прихованих) та монстрів. Іноді, щоб дістатися до виходу, треба натискати відкриваючі проходи важелі та шукати картки-ключі для замкнених дверей.
Для винищення монстрів є аж 8 видів зброї — кулаки, бензопила, пістолет, дробовик, кулемет, ракетниця, плазмомет та надпотужна гармата BFG-9000. Кожен з них має свої особливості при використанні. Наприклад, кулаки та бензопила діють лише в ближньому бою, ракета може пошкодити і вас, якщо вибухне поруч, а BFG випускає додаткові заряди після того, як основний потрапляє в ціль.
По ходу гри також потрібно збирати різні бонуси. Зброю, якої у вас ще немає, аптечки, бронежилет (він приймає на себе частину пошкоджень). У схованках (найчастіше вони знаходяться за дверима, які виглядають як звичайна стіна) можна знайти «супер-бонуси», які підвищують рівень здоров'я та броні до 200%, а також карту рівня. На щастя, карту в грі можна переглянути і так, лише ви побачите лише ті місця, де побували.
Хоча гра в цілому тривимірна, є певні нюанси. Так, пістолет, кулемет і дробовик автоматично потрапляють у ворогів у межах видимості, навіть якщо вони знаходяться набагато вище/нижче вас, а ось ракети та скупчення плазми (а також різні «снаряди» монстрів) мають певний межу для наведення.
Окремо варто згадати мультиплеер. Doom — одна з перших ігор з ним. Поєднуючись по локальній мережі можна проходити гру в кооперативному режимі з товаришами, або боротися один проти одного, заробляючи за кожне вбивство (і втрачаючи за кожне «самогубство») очки, які в грі називаються фрагами.
Це слово «фраг», а також назва режиму Deathmatch після виходу гри стали відомими загальноігровими термінами. Не в останню чергу і завдяки неймовірній популярності Doom, її сиквела та інших ігор id Software.