Będziesz grać jako były marine, który został degradujący do sprzątacza i przeniesiony do pracy na Marsie, w kompleksie laboratoryjnym korporacji UAC. Coś poszło nie tak z eksperymentem z nową technologią teleportacji i teraz wszystkie pomieszczenia marsjańskiej bazy są pełne potworów i szalejącej ochrony. A główny bohater – jedyny ocalały, który musi wydostać się z tego piekła.
Jednak fabuła gry to tylko kilka stron w pliku i tekście na końcu każdego z trzech (lub czterech w wydaniu Ultimate) epizodów. Najważniejszym elementem Doom jest rozgrywka, która uczyniła grę przełomową w gatunku trójwymiarowych strzelanek.
Każdy z epizodów składa się z dziewięciu poziomów (jeden z nich jest sekretny i nie jest obowiązkowy do zaliczenia). Na każdym poziomie musisz dotrzeć od wejścia do wyjścia (a często trzeba nacisnąć odpowiedni dźwignię). Poziom to labirynt z wieloma przejściami, drzwiami (w tym ukrytymi) i potworami. Czasami, aby dotrzeć do wyjścia, musisz nacisnąć dźwignie otwierające przejścia oraz szukać kart-kluczy do zamkniętych drzwi.
Do eksterminacji potworów dostępnych jest aż 8 rodzajów broni – kastet, piła łańcuchowa, pistolet, strzelba, karabin maszynowy, wyrzutnia rakiet, plazmowy karabin i superbroń BFG-9000. Każda z nich ma swoje cechy przy użyciu. Na przykład, kastet i piła łańcuchowa działają tylko w walce wręcz, rakieta może wyrządzić krzywdę również tobie, jeśli wybuchnie blisko, a BFG wypuszcza dodatkowe ładunki po tym, jak główny trafi cel.
W trakcie gry trzeba również zbierać różne bonusy. Broń, której jeszcze nie masz, apteczki, kamizelka kuloodporna (która przyjmuje część obrażeń). W ukrytych miejscach (najczęściej znajdują się za drzwiami, które wyglądają jak zwykła ściana) można znaleźć „super-bonusy”, które podnoszą poziom zdrowia i zbroi do 200%, a także mapę poziomu. Na szczęście w grze można również sprawdzić mapę, ale zobaczysz tylko te miejsca, w których już byłeś.
Choć gra w całości jest trójwymiarowa, istnieją pewne niuanse. Tak, pistolet, karabin maszynowy i strzelba automatycznie trafiają w wrogów w zasięgu wzroku, nawet jeśli są znacznie wyżej/niżej od ciebie, natomiast rakiety i skupiska plazmy (a także różne „pociski” potworów) mają określony zasięg do namierzania.
Osobno warto wspomnieć o trybie wieloosobowym. Doom – jedna z pierwszych gier z tym trybem. Można współpracować przez sieć lokalną, przechodząc grę w trybie kooperacji z towarzyszami lub walczyć ze sobą, zdobywając punkty za każde zabójstwo (i tracąc za każde „samobójstwo”), które w grze nazywane są fragmentami.
To słowo „fragment”, a także nazwa trybu Deathmatch po premierze gry stały się znanymi terminami gamingowymi. Nie bez powodu, a dzięki niewiarygodnej popularności Doom, jej kontynuacji i innych gier id Software.