X-COM: Apocalypse – é o terceiro jogo da série X-COM, desenvolvido em parceria pela Mythos Games e MicroPros. O lançamento de X-COM: Apocalypse ocorreu em 1997. O jogo difere um pouco das duas partes anteriores: X-COM: UFO Defense e X-COM: Terror From The Deep. Entre as mudanças mais significativas, destaca-se a possibilidade dada aos jogadores de jogar em tempo real, embora o modo de turno canônico também não tenha desaparecido.
O ano é 2084, a Terra está em má situação - uma catástrofe ecológica tornará impossível viver na maior parte do planeta. O único lugar onde é possível sobreviver minimamente é a gigantesca megalópole MegaPrime. Como em qualquer cidade, em MegaPrime existem áreas onde é melhor que pessoas comuns não entrem. Ali, o crime prevalece, a máfia está em ação, bandidos vagam livremente e uma substância perigosa chamada Psychlon se espalha. Favelas como elas são. Para tentar diferenciar as boas e as más áreas, a administração de MegaPrime ergue altos muros em volta do foco do banditismo, mas isso não é uma panaceia para todos os problemas.
De modo geral, a vida em MegaPrime não é fácil, mas as coisas ficam ainda piores quando os alienígenas chegam. Primeiro, robôs de reconhecimento aparecem para os habitantes da cidade, seguidos por tropas de combate. Quando percebem que não podem lidar com a invasão de maneira convencional, a administração de MegaPrime recorre à ajuda da X-COM. Somente essa organização pode salvar a humanidade da destruição definitiva.
Em X-COM: Apocalypse, os antagonistas não são os sectóides, mas micro-noides – micro-organismos que submeteram os sectóides. Os micro-noides são os iniciadores da invasão da Terra. Mas o plano para conquistar o planeta não é, claro, realizado por suas próprias mãos (que simplesmente não possuem), mas pelos membros, tentáculos, presas e garras de bio-robôs especialmente criados: antropóides, esqueletóides, spitters, poppers, overspawns, e assim por diante.
Vale ressaltar que nas etapas iniciais os recursos da X-COM são bastante limitados, mas o estudo das tecnologias alienígenas faz maravilhas. A organização avança de tal forma em termos científicos e técnicos que em certo momento ocorre uma inversão de forças – não são mais os alienígenas que atacam, mas os próprios humanos. No final, as unidades da X-COM conseguem alcançar o planeta hostil e destruí-lo, encerrando assim de uma vez por todas essa guerra sangrenta.